1. Ban Lãnh đạo:
Giám đốc: Ông Phan Phùng Hải
Số điện thoại: 0233 3824 999
Phó giám đốc: Ông Lê Văn Châu
Số điện thoại: 0233 3824 111
2. Phòng Tổ chức Hành chính:
Trưởng phòng: Bà Nguyễn Thị Anh Huệ
Phó trưởng phòng: Bà Hoàng Thị Thiên Hương
Số điện thoại: 0233 3824 393
Email: cvhhqttchc@gmail.com
3. Phòng Pháp chế - Thanh tra - An toàn an ninh hàng hải
Trưởng phòng: Ông Nguyễn Văn Phương
Phó trưởng phòng: Ông Ngô Minh Quang
Số điện thoại: 0233 3824 292
Email: cvhhqtphapcheantoan@gmail.com
4. Phòng Tài chính - Kế toán
Trưởng phòng: Ông Lê Đức Thọ
Số điện thoại: 0233 3824 448
Email: cvhhqttaivu@gmail.com
5. Đại diên Cảng vụ Hàng hải Quảng Trị tại Cồn Cỏ
Trưởng đại diện: Ông Hoàng Kiên Cường
Phó trưởng đại diện: Nguyễn Quang Hoà
Số điện thoại: 0233 3689 242
Email: daidienconco@gmail.com